Model E 240 je vybavený 6-valcovým V-motorom so zdvihovým objemom 2,4 litra a výkonom 170 koní. Motor je nástupcom 4-valcovej verzie E 230.
V priebehu roku 1997 bola ponuka motorov triedy E dôkladne prepracovaná. Výsledkom boli modely E 280 a E 320 vybavené 6-valcovými V-motormi, prvé príklady nového Séria motorov M 112. Tieto motory nahradili staré 6-valcové radové jednotky rovnakého zdvihového objemu. Výkon motorov V6 je 204 a 224 koní. Pre porovnanie: radové motory rovnakého objemu ako trieda E modelového roku 1996 mali 193 a 220 k. Krivka krútiaceho momentu oboch V-motorov je plochá medzi 3000-5000 min-1, čo vám umožňuje častejšie používať vyššie prevodové stupne, čím sa znížia otáčky motora a tým aj spotreba paliva. Na zníženie zaťaženia vibráciami motora v tvare V sa použil dodatočný vyvažovací hriadeľ. Vďaka použitiu ľahkých materiálov boli V-motory o 25 % ľahšie ako radové motory. Tieto motory boli prvé vybavené vložkami valcov z ľahkej zliatiny, ktoré poskytujú úsporu paliva vďaka povlaku s nízkym trením. Emisie škodlivých látok sú výrazne znížené vďaka použitiu trojventilovej hlavy valcov a dvoch zapaľovacích sviečok na valec. Tieto opatrenia tiež prispeli k zníženiu spotreby paliva modelu E 280 o 9 – 13 % v porovnaní s jeho predchodcom.