A 4,2 literes 8 hengeres V-motor befecskendező rendszere a HFM vezérlőrendszerhez lett igazítva. A befecskendezési és gyújtásvezérlési funkciók most a Motronic 1.0 motorvezérlő egységben vannak kombinálva. A gyártás kezdete óta E 420-zal szerelt új automata sebességváltó elektronikus vezérlőrendszere integrálva van a motorvezérlő rendszerrel.
Az E 430 váltotta fel az E 420-at. Az új 4,3 literes aggregát az M 113-as motorsorozathoz tartozik, az M 112-es sorozat V-alakú 6-hengeres motorjaival együtt fejlesztették ki.Az E 420 és E 430 motorok ugyanazt innovatív megoldások: hengerenként 3 szelep, hengerenként két gyújtógyertya, alacsony súrlódású hengerbetétek. Az egységeket a Bad Cannstatt-i motorgyárban gyártják.
1996 januárjában az E-osztály modellkínálata az E 50 AMG sportos változatával bővült. Ez egy 8 hengeres V alakú motor, 5 literes lökettérfogattal és 347 LE teljesítménnyel, amelyet az AMG épített 4,2 literes motorra. Ezt követően az E 50 AMG modellt az 5,5 literes lökettérfogatú, 354 LE teljesítményű E 55 AMG motorra cserélték, amely az M 113 sorozathoz tartozik.